Karadžić je uhapšen 21. jula 2008. i izručen Haškom tribunalu, gdje mu je suđenje u toku, a Ratko Mladić je i dalje u bjekstvu.
Prvu optužnicu protiv njih Tribunal u Hagu podigao je 25. jula 1995. za genocid, ratne zločine i zločine protiv čovječnosti. Četiri mjeseca kasnije taj sud podigao je drugu optužnicu za zločine u Srebrenici, koja Karadžića i Mladića tereti za genocid i zločineprotiv čovječnosti, počinjen pošto je VRS zauzela taj grad.
Optužnice protiv njih razdvojene su 14. oktobra 2002. kada je Tribunal otpečatio izmijenjenu i dopunjenu optužnicu protiv Karadžića, koja ga tereti za genocid, saučesništvo u genocidu nad bosanskim Muslimanima i Hrvatima tokom rata u BiH i druge zločine.
U novembru te godine Haški tribunal je objavio izmijenjenu i dopunjenu optužnicu protiv Mladića, koja ga tereti za genocid nad bosanskim Muslimanima i u kojoj su sažete dvije optužnice koje su do tada postojale. Nakon potpisivanja Dejtonskog sporazuma 1995. Ratko Mladić je ukazom bivše predsjednice RS Biljane Plavšić u oktobru 1996. smijenjen sa dužnosti komandanta VRS, a potom penzionisan.
Posljednji intervju Mladić je dao agenciji Rojters 16. aprila 1999. da bi odgovorio na optužbe tadašnjeg britanskog ministra odbrane Džordža Robertsona da je umiješan u rat na Kosovu. Prema pisanju medija, Mladić je po prestanku aktivne vojne službe živio u Beogradu, gdje se pojavljivao i na nekim javnim mjestima. Prema izjavi bivšeg predsednika Nacionalnog savjeta za saradnju Srbije sa sudom u Hagu Rasima Ljajića, Mladić je do 2005. najvećim dijelom bio u Srbiji.
U decembru 2009. Ljajić je podnio ostavku na funkciju u Akcionom timu za hapšenje i lociranje Ratka Mladića, kako je ranije najavio, jer Mladić nije uhapšen do kraja te godine. Ljajić je više puta ponovio da je Srbija talac Mladića i da njegovo skrivanje koči Srbiju na putu evropskih integracija. Holandski zvaničnici ističu da je hapšenje haških begunaca injihovo izručenje Haškom tribunalu uslov da ta zemlja podrži evropsku perspektivu Srbije.SAD su ponudile i novčanu nagradu do pet miliona dolara za pomoć da se pred lice pravde izvedu optuženi za ratne zločine.
U cilju hapšenja haških bjegunaca Vlada Srbije je početkom 2006. izradila Akcioni plan, a nekoliko mjeseci kasnije uhapšeno je više osumnjičenih za skrivanje Ratka Mladića i protiv njih je sudski postupak u toku. Najviši srpski zvaničnici ističu da će preostala dva haška optuženika Ratko Mladić i Goran Hadžić biti uhapšeni i izručeni Hagu čim budu locirani.
