Kako se navodi u optužnici, Trajković je doprinio brojnim ratnim zločinima - od ubistava, preko racija, prebijanja, zlostavljanja, mučenja, te držanja u uslovima ropstva i protjerivanja hiljada albanskih civila.
On je osuđen jer je 6. aprila 1999. godine bio dio vojnih snaga koje su opkolile selo Reznik kod Vučitrna, nakon čega je uslijedilo paljenje kuća i ubijanje civila. Tada je ubijeno devet članova porodice Ujkani, a njihova tijela su spaljena.
Pored toga, Trajković je osuđen jer je 22. maja 1999. godine na gradskom groblju u Vučitrnu bio dio snaga koje su vršile nasilje nad brojnim albanskim civilima. Kako stoji u optužnici, prvo im je bilo naređeno da sjednu na zemlju, potom su ih tukli, a mnogi civili utovareni su u kamione i poslati u zatvor. Tamo su ubijena 72 civila, a brojni drugi su ispitivani i mučeni, a potom protjerani u Albaniju.
