Prvostepenom presudom izrečenom u maju 2013. godine Haški tribunal oslobodio je Stanišića i Simatovića krivice po svim tačkama optužnice.
Pretresno vijeće tada je većinom glasova zaključilo da Stanišić i Simatović nijesu odgovorni za počinjene zločine, koji im se stavljaju na teret i oslobodilo ih svih optužbi, te naložilo da odmah budu pušteni na slobodu.
Oslobađajuću presudu Žalbeno vijeće Haškog tribunala poništilo je u decembru 2015. godine i naložilo novo suđenje, po svim tačkama optužnice.
U optužnici se navodi da su Stanišić i Simatović, visokorangirani zvaničnici SDB-a Srbije bili učesnici udruženog zločinačkog poduhvata, koji je imao za cilj prisilno i trajno uklanjanje većine nesrpskog stanovništva sa područja Hrvatske i BiH.
Prvobitna optužnica protiv Stanišića i Simatovića potvrđena je 1. maja 2003. godine. Simatović je prebačen u pritvor Haškog tribunala 30. maja, a Stanišić 11. juna 2003. godine.
Suđenje je počelo 28. aprila 2008. Međutim, zbog lošeg zdravstvenog stanja Stanišića početak je odgađan nekoliko puta i suđenje je ponovo počelo 9. juna 2009. godine.